Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ITGB2P05107 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ITGB2P05107 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ITGB2P05107 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITGB2P05107 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ITGB2P05107 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGB2P05107 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITGB2P05107 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB2P05107 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB2P05107 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB2P05107 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB2P05107 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB2P05107 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB2P05107 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ITGB2P05107 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ITGB2P05107 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB2P05107 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB2P05107 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB2P05107 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGB2P05107 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB2P05107 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ITGB2P05107 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB2P05107 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ITGB2P05107 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ITGB2P05107 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGB2P05107 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB2P05107 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB2P05107 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB2P05107 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB2P05107 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB2P05107 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB2P05107 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB2P05107 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB2P05107 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGB2P05107 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGB2P05107 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB2P05107 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGB2P05107 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ITGB2P05107 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGB2P05107 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGB2P05107 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB2P05107 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB2P05107 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB2P05107 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB2P05107 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB2P05107 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB2P05107 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB2P05107 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB2P05107 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB2P05107 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB2P05107 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB2P05107 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB2P05107 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB2P05107 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB2P05107 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB2P05107 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB2P05107 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB2P05107 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB2P05107 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB2P05107 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB2P05107 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGB2P05107 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGB2P05107 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB2P05107 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGB2P05107 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGB2P05107 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB2P05107 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB2P05107 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB2P05107 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB2P05107 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB2P05107 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB2P05107 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB2P05107 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB2P05107 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB2P05107 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB2P05107 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB2P05107 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB2P05107 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB2P05107 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB2P05107 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB2P05107 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB2P05107 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB2P05107 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ITGB2P05107 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB2P05107 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB2P05107 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB2P05107 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB2P05107 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB2P05107 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms