Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC71.51■■■■■ 9.04
ABCC9O60706 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC70.83■■■■■ 8.93
ABCC9O60706 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC70.47■■■■■ 8.87
ABCC9O60706 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.11■■■■■ 8.65
ABCC9O60706 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC68.92■■■■■ 8.62
ABCC9O60706 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC68.57■■■■■ 8.57
ABCC9O60706 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.48■■■■■ 8.55
ABCC9O60706 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC68.24■■■■■ 8.51
ABCC9O60706 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC68.19■■■■■ 8.51
ABCC9O60706 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC68.09■■■■■ 8.49
ABCC9O60706 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC67.46■■■■■ 8.39
ABCC9O60706 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC67.44■■■■■ 8.39
ABCC9O60706 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC67.33■■■■■ 8.37
ABCC9O60706 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC67.15■■■■■ 8.34
ABCC9O60706 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC67.09■■■■■ 8.33
ABCC9O60706 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.97■■■■■ 8.31
ABCC9O60706 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.76■■■■■ 8.28
ABCC9O60706 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC66.28■■■■■ 8.2
ABCC9O60706 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC66.14■■■■■ 8.18
ABCC9O60706 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC66.14■■■■■ 8.18
ABCC9O60706 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC66.07■■■■■ 8.17
ABCC9O60706 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC65.98■■■■■ 8.15
ABCC9O60706 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC65.96■■■■■ 8.15
ABCC9O60706 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC65.88■■■■■ 8.14
ABCC9O60706 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC65.76■■■■■ 8.12
ABCC9O60706 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC65.64■■■■■ 8.1
ABCC9O60706 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC65.64■■■■■ 8.1
ABCC9O60706 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC65.61■■■■■ 8.09
ABCC9O60706 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC65.56■■■■■ 8.09
ABCC9O60706 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC65.41■■■■■ 8.06
ABCC9O60706 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC64.78■■■■■ 7.96
ABCC9O60706 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC64.69■■■■■ 7.95
ABCC9O60706 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC64.66■■■■■ 7.94
ABCC9O60706 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC64.58■■■■■ 7.93
ABCC9O60706 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC64.32■■■■■ 7.89
ABCC9O60706 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC64.32■■■■■ 7.89
ABCC9O60706 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC64.3■■■■■ 7.88
ABCC9O60706 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC63.72■■■■■ 7.79
ABCC9O60706 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC63.71■■■■■ 7.79
ABCC9O60706 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC63.69■■■■■ 7.79
ABCC9O60706 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC63.69■■■■■ 7.79
ABCC9O60706 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC63.44■■■■■ 7.75
ABCC9O60706 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC63.37■■■■■ 7.73
ABCC9O60706 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC63.36■■■■■ 7.73
ABCC9O60706 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC63.35■■■■■ 7.73
ABCC9O60706 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.34■■■■■ 7.73
ABCC9O60706 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC63.21■■■■■ 7.71
ABCC9O60706 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC63.21■■■■■ 7.71
ABCC9O60706 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.2■■■■■ 7.71
ABCC9O60706 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC63.07■■■■■ 7.69
ABCC9O60706 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC63.01■■■■■ 7.68
ABCC9O60706 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC62.97■■■■■ 7.67
ABCC9O60706 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC62.91■■■■■ 7.66
ABCC9O60706 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC62.86■■■■■ 7.65
ABCC9O60706 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC62.84■■■■■ 7.65
ABCC9O60706 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.83■■■■■ 7.65
ABCC9O60706 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC62.81■■■■■ 7.65
ABCC9O60706 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC62.63■■■■■ 7.62
ABCC9O60706 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.63■■■■■ 7.62
ABCC9O60706 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC62.57■■■■■ 7.61
ABCC9O60706 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC62.53■■■■■ 7.6
ABCC9O60706 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC62.46■■■■■ 7.59
ABCC9O60706 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC62.38■■■■■ 7.58
ABCC9O60706 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC62.34■■■■■ 7.57
ABCC9O60706 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.28■■■■■ 7.56
ABCC9O60706 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC62.23■■■■■ 7.55
ABCC9O60706 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC62.2■■■■■ 7.55
ABCC9O60706 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC62.18■■■■■ 7.55
ABCC9O60706 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.18■■■■■ 7.54
ABCC9O60706 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC62.15■■■■■ 7.54
ABCC9O60706 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC62.1■■■■■ 7.53
ABCC9O60706 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC62.07■■■■■ 7.53
ABCC9O60706 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC62.05■■■■■ 7.52
ABCC9O60706 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC62■■■■■ 7.52
ABCC9O60706 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC61.96■■■■■ 7.51
ABCC9O60706 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC61.92■■■■■ 7.5
ABCC9O60706 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.92■■■■■ 7.5
ABCC9O60706 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC61.92■■■■■ 7.5
ABCC9O60706 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC61.9■■■■■ 7.5
ABCC9O60706 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC61.86■■■■■ 7.49
ABCC9O60706 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.85■■■■■ 7.49
ABCC9O60706 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.84■■■■■ 7.49
ABCC9O60706 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.82■■■■■ 7.49
ABCC9O60706 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC61.78■■■■■ 7.48
ABCC9O60706 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC61.78■■■■■ 7.48
ABCC9O60706 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC61.7■■■■■ 7.47
ABCC9O60706 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC61.68■■■■■ 7.47
ABCC9O60706 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.63■■■■■ 7.46
ABCC9O60706 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC61.63■■■■■ 7.46
ABCC9O60706 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.53■■■■■ 7.44
ABCC9O60706 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.52■■■■■ 7.44
ABCC9O60706 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC61.52■■■■■ 7.44
ABCC9O60706 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC61.52■■■■■ 7.44
ABCC9O60706 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.44■■■■■ 7.43
ABCC9O60706 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.42■■■■■ 7.42
ABCC9O60706 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC61.4■■■■■ 7.42
ABCC9O60706 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC61.38■■■■■ 7.42
ABCC9O60706 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC61.35■■■■■ 7.41
ABCC9O60706 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC61.29■■■■■ 7.4
ABCC9O60706 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC61.28■■■■■ 7.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 823 ms