Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57,82■■■■■ 6,85
SYNJ2O15056 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57,55■■■■■ 6,8
SYNJ2O15056 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57,09■■■■■ 6,73
SYNJ2O15056 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,34■■■■■ 6,61
SYNJ2O15056 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,63■■■■■ 6,5
SYNJ2O15056 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55,2■■■■■ 6,43
SYNJ2O15056 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55,17■■■■■ 6,42
SYNJ2O15056 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55,07■■■■■ 6,41
SYNJ2O15056 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55,03■■■■■ 6,4
SYNJ2O15056 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54,93■■■■■ 6,38
SYNJ2O15056 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,76■■■■■ 6,36
SYNJ2O15056 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC54,67■■■■■ 6,34
SYNJ2O15056 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54,55■■■■■ 6,32
SYNJ2O15056 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,41■■■■■ 6,3
SYNJ2O15056 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54,39■■■■■ 6,3
SYNJ2O15056 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,29■■■■■ 6,28
SYNJ2O15056 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53,82■■■■■ 6,21
SYNJ2O15056 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53,68■■■■■ 6,18
SYNJ2O15056 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53,62■■■■■ 6,17
SYNJ2O15056 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,47■■■■■ 6,15
SYNJ2O15056 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,42■■■■■ 6,14
SYNJ2O15056 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53,42■■■■■ 6,14
SYNJ2O15056 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53,31■■■■■ 6,12
SYNJ2O15056 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53,25■■■■■ 6,11
SYNJ2O15056 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,19■■■■■ 6,1
SYNJ2O15056 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53,16■■■■■ 6,1
SYNJ2O15056 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52,94■■■■■ 6,06
SYNJ2O15056 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52,91■■■■■ 6,06
SYNJ2O15056 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52,83■■■■■ 6,05
SYNJ2O15056 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52,75■■■■■ 6,03
SYNJ2O15056 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52,7■■■■■ 6,03
SYNJ2O15056 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,37■■■■■ 5,97
SYNJ2O15056 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52,21■■■■■ 5,95
SYNJ2O15056 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,09■■■■■ 5,93
SYNJ2O15056 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52,08■■■■■ 5,93
SYNJ2O15056 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52,07■■■■■ 5,93
SYNJ2O15056 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52,01■■■■■ 5,92
SYNJ2O15056 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51,63■■■■■ 5,86
SYNJ2O15056 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51,62■■■■■ 5,85
SYNJ2O15056 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,48■■■■■ 5,83
SYNJ2O15056 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51,42■■■■■ 5,82
SYNJ2O15056 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51,32■■■■■ 5,81
SYNJ2O15056 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51,22■■■■■ 5,79
SYNJ2O15056 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51,18■■■■■ 5,78
SYNJ2O15056 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51,18■■■■■ 5,78
SYNJ2O15056 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51,17■■■■■ 5,78
SYNJ2O15056 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51,01■■■■■ 5,76
SYNJ2O15056 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51,01■■■■■ 5,76
SYNJ2O15056 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,99■■■■■ 5,75
SYNJ2O15056 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50,95■■■■■ 5,75
SYNJ2O15056 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50,94■■■■■ 5,74
SYNJ2O15056 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50,88■■■■■ 5,74
SYNJ2O15056 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50,88■■■■■ 5,74
SYNJ2O15056 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50,84■■■■■ 5,73
SYNJ2O15056 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50,82■■■■■ 5,73
SYNJ2O15056 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50,78■■■■■ 5,72
SYNJ2O15056 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50,74■■■■■ 5,71
SYNJ2O15056 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50,65■■■■■ 5,7
SYNJ2O15056 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50,59■■■■■ 5,69
SYNJ2O15056 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,57■■■■■ 5,69
SYNJ2O15056 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50,51■■■■■ 5,68
SYNJ2O15056 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50,5■■■■■ 5,67
SYNJ2O15056 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,41■■■■■ 5,66
SYNJ2O15056 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,37■■■■■ 5,65
SYNJ2O15056 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,36■■■■■ 5,65
SYNJ2O15056 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50,35■■■■■ 5,65
SYNJ2O15056 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50,34■■■■■ 5,65
SYNJ2O15056 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50,28■■■■■ 5,64
SYNJ2O15056 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50,26■■■■■ 5,64
SYNJ2O15056 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,21■■■■■ 5,63
SYNJ2O15056 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50,12■■■■■ 5,61
SYNJ2O15056 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50,11■■■■■ 5,61
SYNJ2O15056 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5,59
SYNJ2O15056 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50■■■■■ 5,59
SYNJ2O15056 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49,93■■■■■ 5,58
SYNJ2O15056 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,88■■■■■ 5,58
SYNJ2O15056 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49,88■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,87■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,84■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49,83■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,82■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,82■■■■■ 5,57
SYNJ2O15056 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49,79■■■■■ 5,56
SYNJ2O15056 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49,76■■■■■ 5,56
SYNJ2O15056 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49,73■■■■■ 5,55
SYNJ2O15056 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49,71■■■■■ 5,55
SYNJ2O15056 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49,7■■■■■ 5,55
SYNJ2O15056 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49,63■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49,62■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49,62■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49,6■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49,6■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49,59■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,59■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,57■■■■■ 5,53
SYNJ2O15056 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49,56■■■■■ 5,52
SYNJ2O15056 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49,53■■■■■ 5,52
SYNJ2O15056 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,52■■■■■ 5,52
SYNJ2O15056 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49,51■■■■■ 5,52
SYNJ2O15056 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC49,5■■■■■ 5,51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10,7 ms