Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC57.82■■■■■ 6.85
SYNJ2O15056 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57.55■■■■■ 6.8
SYNJ2O15056 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.09■■■■■ 6.73
SYNJ2O15056 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.34■■■■■ 6.61
SYNJ2O15056 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.63■■■■■ 6.5
SYNJ2O15056 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.2■■■■■ 6.43
SYNJ2O15056 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.17■■■■■ 6.42
SYNJ2O15056 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.07■■■■■ 6.41
SYNJ2O15056 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.03■■■■■ 6.4
SYNJ2O15056 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.93■■■■■ 6.38
SYNJ2O15056 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.76■■■■■ 6.36
SYNJ2O15056 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC54.67■■■■■ 6.34
SYNJ2O15056 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.55■■■■■ 6.32
SYNJ2O15056 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
SYNJ2O15056 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.39■■■■■ 6.3
SYNJ2O15056 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
SYNJ2O15056 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.82■■■■■ 6.21
SYNJ2O15056 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
SYNJ2O15056 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.62■■■■■ 6.17
SYNJ2O15056 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
SYNJ2O15056 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
SYNJ2O15056 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
SYNJ2O15056 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.31■■■■■ 6.12
SYNJ2O15056 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.11
SYNJ2O15056 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.1
SYNJ2O15056 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.16■■■■■ 6.1
SYNJ2O15056 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.94■■■■■ 6.06
SYNJ2O15056 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.91■■■■■ 6.06
SYNJ2O15056 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.83■■■■■ 6.05
SYNJ2O15056 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.75■■■■■ 6.03
SYNJ2O15056 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.7■■■■■ 6.03
SYNJ2O15056 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.37■■■■■ 5.97
SYNJ2O15056 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.21■■■■■ 5.95
SYNJ2O15056 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.09■■■■■ 5.93
SYNJ2O15056 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.08■■■■■ 5.93
SYNJ2O15056 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.07■■■■■ 5.93
SYNJ2O15056 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
SYNJ2O15056 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.63■■■■■ 5.86
SYNJ2O15056 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.62■■■■■ 5.85
SYNJ2O15056 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
SYNJ2O15056 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.42■■■■■ 5.82
SYNJ2O15056 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
SYNJ2O15056 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
SYNJ2O15056 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
SYNJ2O15056 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
SYNJ2O15056 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.17■■■■■ 5.78
SYNJ2O15056 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.01■■■■■ 5.76
SYNJ2O15056 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
SYNJ2O15056 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
SYNJ2O15056 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
SYNJ2O15056 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
SYNJ2O15056 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC50.88■■■■■ 5.74
SYNJ2O15056 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.88■■■■■ 5.74
SYNJ2O15056 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC50.84■■■■■ 5.73
SYNJ2O15056 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.82■■■■■ 5.73
SYNJ2O15056 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.78■■■■■ 5.72
SYNJ2O15056 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
SYNJ2O15056 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.65■■■■■ 5.7
SYNJ2O15056 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.59■■■■■ 5.69
SYNJ2O15056 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
SYNJ2O15056 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
SYNJ2O15056 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
SYNJ2O15056 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
SYNJ2O15056 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
SYNJ2O15056 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
SYNJ2O15056 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
SYNJ2O15056 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.34■■■■■ 5.65
SYNJ2O15056 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
SYNJ2O15056 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.26■■■■■ 5.64
SYNJ2O15056 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
SYNJ2O15056 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.12■■■■■ 5.61
SYNJ2O15056 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.11■■■■■ 5.61
SYNJ2O15056 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
SYNJ2O15056 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50■■■■■ 5.59
SYNJ2O15056 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
SYNJ2O15056 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
SYNJ2O15056 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49.88■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC49.83■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
SYNJ2O15056 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
SYNJ2O15056 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
SYNJ2O15056 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
SYNJ2O15056 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
SYNJ2O15056 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
SYNJ2O15056 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC49.63■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC49.62■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.59■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
SYNJ2O15056 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
SYNJ2O15056 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
SYNJ2O15056 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
SYNJ2O15056 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
SYNJ2O15056 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms