Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.42■■■■■ 6.3
KDM6BO15054 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.95■■■■■ 6.23
KDM6BO15054 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.36■■■■■ 6.13
KDM6BO15054 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
KDM6BO15054 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
KDM6BO15054 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
KDM6BO15054 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
KDM6BO15054 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.97■■■■■ 5.91
KDM6BO15054 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
KDM6BO15054 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
KDM6BO15054 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.49■■■■■ 5.83
KDM6BO15054 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.27■■■■■ 5.8
KDM6BO15054 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
KDM6BO15054 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.98■■■■■ 5.75
KDM6BO15054 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
KDM6BO15054 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.87■■■■■ 5.73
KDM6BO15054 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
KDM6BO15054 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
KDM6BO15054 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
KDM6BO15054 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.27■■■■■ 5.64
KDM6BO15054 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.25■■■■■ 5.63
KDM6BO15054 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.24■■■■■ 5.63
KDM6BO15054 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.13■■■■■ 5.62
KDM6BO15054 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.07■■■■■ 5.61
KDM6BO15054 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
KDM6BO15054 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
KDM6BO15054 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
KDM6BO15054 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.85■■■■■ 5.57
KDM6BO15054 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
KDM6BO15054 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
KDM6BO15054 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
KDM6BO15054 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
KDM6BO15054 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
KDM6BO15054 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
KDM6BO15054 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.01■■■■■ 5.44
KDM6BO15054 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.88■■■■■ 5.42
KDM6BO15054 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.83■■■■■ 5.41
KDM6BO15054 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
KDM6BO15054 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
KDM6BO15054 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
KDM6BO15054 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
KDM6BO15054 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
KDM6BO15054 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.35■■■■■ 5.33
KDM6BO15054 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.29■■■■■ 5.32
KDM6BO15054 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
KDM6BO15054 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.32
KDM6BO15054 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
KDM6BO15054 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.2■■■■■ 5.31
KDM6BO15054 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC48.08■■■■■ 5.29
KDM6BO15054 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.29
KDM6BO15054 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
KDM6BO15054 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
KDM6BO15054 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
KDM6BO15054 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
KDM6BO15054 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
KDM6BO15054 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
KDM6BO15054 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
KDM6BO15054 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
KDM6BO15054 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
KDM6BO15054 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
KDM6BO15054 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
KDM6BO15054 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
KDM6BO15054 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.48■■■■■ 5.19
KDM6BO15054 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
KDM6BO15054 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.44■■■■■ 5.18
KDM6BO15054 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
KDM6BO15054 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
KDM6BO15054 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
KDM6BO15054 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
KDM6BO15054 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
KDM6BO15054 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
KDM6BO15054 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
KDM6BO15054 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
KDM6BO15054 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
KDM6BO15054 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
KDM6BO15054 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
KDM6BO15054 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
KDM6BO15054 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
KDM6BO15054 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
KDM6BO15054 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
KDM6BO15054 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
KDM6BO15054 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
KDM6BO15054 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.05■■■■■ 5.12
KDM6BO15054 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
KDM6BO15054 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47■■■■■ 5.11
KDM6BO15054 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
KDM6BO15054 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
KDM6BO15054 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
KDM6BO15054 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
KDM6BO15054 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
KDM6BO15054 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
KDM6BO15054 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
KDM6BO15054 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
KDM6BO15054 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
KDM6BO15054 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.76■■■■■ 5.08
KDM6BO15054 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
KDM6BO15054 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
KDM6BO15054 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
KDM6BO15054 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
KDM6BO15054 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms