Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.07■■■■■ 6.89
CHD1O14646 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.53■■■■■ 6.8
CHD1O14646 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC57.5■■■■■ 6.79
CHD1O14646 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.35■■■■■ 6.61
CHD1O14646 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
CHD1O14646 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.62■■■■■ 6.49
CHD1O14646 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.55■■■■■ 6.48
CHD1O14646 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.49■■■■■ 6.47
CHD1O14646 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.45■■■■■ 6.47
CHD1O14646 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.43■■■■■ 6.46
CHD1O14646 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.01■■■■■ 6.4
CHD1O14646 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.93■■■■■ 6.38
CHD1O14646 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC54.74■■■■■ 6.35
CHD1O14646 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
CHD1O14646 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.62■■■■■ 6.33
CHD1O14646 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.49■■■■■ 6.31
CHD1O14646 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.18■■■■■ 6.26
CHD1O14646 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
CHD1O14646 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
CHD1O14646 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
CHD1O14646 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.8■■■■■ 6.2
CHD1O14646 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
CHD1O14646 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
CHD1O14646 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
CHD1O14646 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.45■■■■■ 6.15
CHD1O14646 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.37■■■■■ 6.13
CHD1O14646 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.29■■■■■ 6.12
CHD1O14646 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CHD1O14646 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
CHD1O14646 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.17■■■■■ 6.1
CHD1O14646 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.97■■■■■ 6.07
CHD1O14646 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.73■■■■■ 6.03
CHD1O14646 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
CHD1O14646 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
CHD1O14646 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.31■■■■■ 5.96
CHD1O14646 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.28■■■■■ 5.96
CHD1O14646 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
CHD1O14646 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CHD1O14646 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.7■■■■■ 5.87
CHD1O14646 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CHD1O14646 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.63■■■■■ 5.86
CHD1O14646 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.5■■■■■ 5.83
CHD1O14646 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
CHD1O14646 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
CHD1O14646 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
CHD1O14646 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
CHD1O14646 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
CHD1O14646 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.35■■■■■ 5.81
CHD1O14646 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
CHD1O14646 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.24■■■■■ 5.79
CHD1O14646 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.23■■■■■ 5.79
CHD1O14646 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.21■■■■■ 5.79
CHD1O14646 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
CHD1O14646 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
CHD1O14646 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
CHD1O14646 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
CHD1O14646 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
CHD1O14646 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
CHD1O14646 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
CHD1O14646 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
CHD1O14646 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC51■■■■■ 5.75
CHD1O14646 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
CHD1O14646 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.74
CHD1O14646 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
CHD1O14646 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
CHD1O14646 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.56■■■■■ 5.68
CHD1O14646 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
CHD1O14646 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.54■■■■■ 5.68
CHD1O14646 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
CHD1O14646 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
CHD1O14646 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
CHD1O14646 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
CHD1O14646 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.36■■■■■ 5.65
CHD1O14646 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
CHD1O14646 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
CHD1O14646 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
CHD1O14646 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CHD1O14646 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.25■■■■■ 5.63
CHD1O14646 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.19■■■■■ 5.62
CHD1O14646 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CHD1O14646 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.17■■■■■ 5.62
CHD1O14646 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
CHD1O14646 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.15■■■■■ 5.62
CHD1O14646 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
CHD1O14646 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.11■■■■■ 5.61
CHD1O14646 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CHD1O14646 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CHD1O14646 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CHD1O14646 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
CHD1O14646 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CHD1O14646 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
CHD1O14646 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
CHD1O14646 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.57
CHD1O14646 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
CHD1O14646 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC49.87■■■■■ 5.57
CHD1O14646 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
CHD1O14646 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms