Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
BCL9O00512 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.62■■■■■ 4.89
BCL9O00512 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
BCL9O00512 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
BCL9O00512 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
BCL9O00512 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
BCL9O00512 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
BCL9O00512 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
BCL9O00512 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
BCL9O00512 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
BCL9O00512 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
BCL9O00512 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BCL9O00512 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BCL9O00512 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
BCL9O00512 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
BCL9O00512 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
BCL9O00512 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
BCL9O00512 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
BCL9O00512 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
BCL9O00512 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
BCL9O00512 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
BCL9O00512 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
BCL9O00512 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
BCL9O00512 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
BCL9O00512 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
BCL9O00512 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
BCL9O00512 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
BCL9O00512 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
BCL9O00512 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
BCL9O00512 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
BCL9O00512 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
BCL9O00512 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
BCL9O00512 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
BCL9O00512 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
BCL9O00512 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
BCL9O00512 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
BCL9O00512 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
BCL9O00512 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
BCL9O00512 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
BCL9O00512 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
BCL9O00512 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
BCL9O00512 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
BCL9O00512 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
BCL9O00512 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BCL9O00512 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
BCL9O00512 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
BCL9O00512 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BCL9O00512 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
BCL9O00512 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
BCL9O00512 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
BCL9O00512 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
BCL9O00512 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
BCL9O00512 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
BCL9O00512 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
BCL9O00512 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
BCL9O00512 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
BCL9O00512 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
BCL9O00512 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
BCL9O00512 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
BCL9O00512 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
BCL9O00512 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
BCL9O00512 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
BCL9O00512 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
BCL9O00512 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
BCL9O00512 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BCL9O00512 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BCL9O00512 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
BCL9O00512 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
BCL9O00512 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
BCL9O00512 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
BCL9O00512 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
BCL9O00512 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
BCL9O00512 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
BCL9O00512 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
BCL9O00512 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
BCL9O00512 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BCL9O00512 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
BCL9O00512 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
BCL9O00512 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BCL9O00512 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
BCL9O00512 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
BCL9O00512 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCL9O00512 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
BCL9O00512 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
BCL9O00512 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
BCL9O00512 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
BCL9O00512 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
BCL9O00512 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BCL9O00512 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
BCL9O00512 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BCL9O00512 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BCL9O00512 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BCL9O00512 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
BCL9O00512 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
BCL9O00512 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
BCL9O00512 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
BCL9O00512 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
BCL9O00512 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
BCL9O00512 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
BCL9O00512 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms