Protein–RNA interactions for Protein: F5GYI3

UBAP1L, Ubiquitin-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1LF5GYI3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
UBAP1LF5GYI3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.3■■■■■ 5.48
UBAP1LF5GYI3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.7■■■■■ 5.39
UBAP1LF5GYI3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
UBAP1LF5GYI3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
UBAP1LF5GYI3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
UBAP1LF5GYI3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
UBAP1LF5GYI3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.48■■■■■ 5.19
UBAP1LF5GYI3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
UBAP1LF5GYI3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
UBAP1LF5GYI3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
UBAP1LF5GYI3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
UBAP1LF5GYI3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.69■■■■■ 5.06
UBAP1LF5GYI3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
UBAP1LF5GYI3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
UBAP1LF5GYI3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
UBAP1LF5GYI3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.24■■■■■ 4.99
UBAP1LF5GYI3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
UBAP1LF5GYI3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
UBAP1LF5GYI3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
UBAP1LF5GYI3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
UBAP1LF5GYI3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.97■■■■■ 4.95
UBAP1LF5GYI3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
UBAP1LF5GYI3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
UBAP1LF5GYI3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
UBAP1LF5GYI3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
UBAP1LF5GYI3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
UBAP1LF5GYI3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
UBAP1LF5GYI3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.49■■■■■ 4.87
UBAP1LF5GYI3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
UBAP1LF5GYI3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
UBAP1LF5GYI3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
UBAP1LF5GYI3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
UBAP1LF5GYI3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
UBAP1LF5GYI3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
UBAP1LF5GYI3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
UBAP1LF5GYI3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
UBAP1LF5GYI3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
UBAP1LF5GYI3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
UBAP1LF5GYI3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
UBAP1LF5GYI3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
UBAP1LF5GYI3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
UBAP1LF5GYI3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
UBAP1LF5GYI3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.19■■■■■ 4.66
UBAP1LF5GYI3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
UBAP1LF5GYI3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
UBAP1LF5GYI3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
UBAP1LF5GYI3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
UBAP1LF5GYI3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
UBAP1LF5GYI3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
UBAP1LF5GYI3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
UBAP1LF5GYI3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
UBAP1LF5GYI3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
UBAP1LF5GYI3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
UBAP1LF5GYI3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
UBAP1LF5GYI3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
UBAP1LF5GYI3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
UBAP1LF5GYI3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
UBAP1LF5GYI3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
UBAP1LF5GYI3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
UBAP1LF5GYI3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
UBAP1LF5GYI3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
UBAP1LF5GYI3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
UBAP1LF5GYI3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
UBAP1LF5GYI3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
UBAP1LF5GYI3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
UBAP1LF5GYI3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
UBAP1LF5GYI3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
UBAP1LF5GYI3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
UBAP1LF5GYI3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
UBAP1LF5GYI3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
UBAP1LF5GYI3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
UBAP1LF5GYI3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
UBAP1LF5GYI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
UBAP1LF5GYI3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
UBAP1LF5GYI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
UBAP1LF5GYI3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
UBAP1LF5GYI3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
UBAP1LF5GYI3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
UBAP1LF5GYI3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
UBAP1LF5GYI3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
UBAP1LF5GYI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
UBAP1LF5GYI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
UBAP1LF5GYI3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
UBAP1LF5GYI3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
UBAP1LF5GYI3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
UBAP1LF5GYI3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
UBAP1LF5GYI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
UBAP1LF5GYI3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
UBAP1LF5GYI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
UBAP1LF5GYI3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
UBAP1LF5GYI3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
UBAP1LF5GYI3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
UBAP1LF5GYI3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
UBAP1LF5GYI3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms