Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNQ9UQP3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms