Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
TNNQ9UQP3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TNNQ9UQP3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
TNNQ9UQP3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TNNQ9UQP3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TNNQ9UQP3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
TNNQ9UQP3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
TNNQ9UQP3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TNNQ9UQP3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TNNQ9UQP3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
TNNQ9UQP3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
TNNQ9UQP3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
TNNQ9UQP3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TNNQ9UQP3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TNNQ9UQP3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TNNQ9UQP3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TNNQ9UQP3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNNQ9UQP3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
TNNQ9UQP3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TNNQ9UQP3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNNQ9UQP3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TNNQ9UQP3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TNNQ9UQP3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNNQ9UQP3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNNQ9UQP3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
TNNQ9UQP3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNNQ9UQP3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TNNQ9UQP3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TNNQ9UQP3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TNNQ9UQP3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TNNQ9UQP3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TNNQ9UQP3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TNNQ9UQP3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TNNQ9UQP3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TNNQ9UQP3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TNNQ9UQP3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TNNQ9UQP3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TNNQ9UQP3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TNNQ9UQP3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TNNQ9UQP3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
TNNQ9UQP3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TNNQ9UQP3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNNQ9UQP3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TNNQ9UQP3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TNNQ9UQP3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TNNQ9UQP3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TNNQ9UQP3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TNNQ9UQP3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TNNQ9UQP3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNNQ9UQP3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TNNQ9UQP3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNNQ9UQP3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TNNQ9UQP3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TNNQ9UQP3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TNNQ9UQP3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TNNQ9UQP3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNNQ9UQP3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
TNNQ9UQP3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TNNQ9UQP3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TNNQ9UQP3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
TNNQ9UQP3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNNQ9UQP3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TNNQ9UQP3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNNQ9UQP3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
TNNQ9UQP3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TNNQ9UQP3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TNNQ9UQP3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TNNQ9UQP3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TNNQ9UQP3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TNNQ9UQP3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
TNNQ9UQP3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TNNQ9UQP3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TNNQ9UQP3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TNNQ9UQP3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TNNQ9UQP3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNNQ9UQP3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNNQ9UQP3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNNQ9UQP3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNNQ9UQP3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TNNQ9UQP3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNNQ9UQP3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNNQ9UQP3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNNQ9UQP3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNNQ9UQP3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNNQ9UQP3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNNQ9UQP3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNNQ9UQP3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNNQ9UQP3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TNNQ9UQP3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TNNQ9UQP3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TNNQ9UQP3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TNNQ9UQP3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TNNQ9UQP3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNNQ9UQP3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TNNQ9UQP3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TNNQ9UQP3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms