Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM79Q9BSE2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms