Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 216.42■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 AP2A2-223ENST00000534485 556 ntTSL 416.1■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 214.87□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 45.1
TBRG4Q969Z0 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 MAST2-204ENST00000467367 859 ntTSL 28.97□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 38.34□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 45.1
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TBRG4Q969Z0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 45
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TBRG4Q969Z0 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 45
TBRG4Q969Z0 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.67e-7■■■■■ 45
TBRG4Q969Z0 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 45
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TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 45
TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 45
TBRG4Q969Z0 SERINC3-201ENST00000255175 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 SERINC3-202ENST00000342374 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 55.58□□□□□ -1.522e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 USP6NL-204ENST00000606752 1823 ntTSL 1 (best)21.51■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 USP6NL-206ENST00000609853 1748 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 USP6NL-203ENST00000443016 2491 ntTSL 28.53□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 TNS3-208ENST00000457718 3836 ntTSL 510.95□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 44.9
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 44.8
TBRG4Q969Z0 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 44.8
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