Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IRGMA1A4Y4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms