Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IRGMA1A4Y4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRGMA1A4Y4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IRGMA1A4Y4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IRGMA1A4Y4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRGMA1A4Y4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRGMA1A4Y4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
IRGMA1A4Y4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IRGMA1A4Y4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRGMA1A4Y4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRGMA1A4Y4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRGMA1A4Y4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRGMA1A4Y4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRGMA1A4Y4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRGMA1A4Y4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRGMA1A4Y4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRGMA1A4Y4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IRGMA1A4Y4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IRGMA1A4Y4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRGMA1A4Y4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IRGMA1A4Y4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRGMA1A4Y4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGMA1A4Y4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRGMA1A4Y4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRGMA1A4Y4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRGMA1A4Y4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRGMA1A4Y4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRGMA1A4Y4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGMA1A4Y4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRGMA1A4Y4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRGMA1A4Y4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRGMA1A4Y4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRGMA1A4Y4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRGMA1A4Y4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IRGMA1A4Y4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRGMA1A4Y4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRGMA1A4Y4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRGMA1A4Y4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRGMA1A4Y4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRGMA1A4Y4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRGMA1A4Y4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRGMA1A4Y4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IRGMA1A4Y4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRGMA1A4Y4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRGMA1A4Y4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IRGMA1A4Y4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRGMA1A4Y4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IRGMA1A4Y4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRGMA1A4Y4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGMA1A4Y4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRGMA1A4Y4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IRGMA1A4Y4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
IRGMA1A4Y4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRGMA1A4Y4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRGMA1A4Y4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRGMA1A4Y4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRGMA1A4Y4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IRGMA1A4Y4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRGMA1A4Y4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRGMA1A4Y4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRGMA1A4Y4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRGMA1A4Y4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRGMA1A4Y4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRGMA1A4Y4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IRGMA1A4Y4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRGMA1A4Y4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGMA1A4Y4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRGMA1A4Y4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGMA1A4Y4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRGMA1A4Y4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRGMA1A4Y4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRGMA1A4Y4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms