Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT7Q9UIV1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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