RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270879.8

FCN3-201, Transcript of ficolin 3, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene FCN3, Length 1,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCN3-201ENST00000270879 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.71■■■■■ 4.59
FCN3-201ENST00000270879 ABCC9O60706 1549 aa39.85■■■■□ 3.97
FCN3-201ENST00000270879 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.39■■■■□ 3.9
FCN3-201ENST00000270879 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.72■■■■□ 3.63
FCN3-201ENST00000270879 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.7■■■■□ 3.63
FCN3-201ENST00000270879 NACADO15069 1562 aa37.35■■■■□ 3.57
FCN3-201ENST00000270879 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.18■■■■□ 3.54
FCN3-201ENST00000270879 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
FCN3-201ENST00000270879 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.85■■■■□ 3.49
FCN3-201ENST00000270879 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.66■■■■□ 3.46
FCN3-201ENST00000270879 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.6■■■■□ 3.45
FCN3-201ENST00000270879 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
FCN3-201ENST00000270879 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.06■■■■□ 3.36
FCN3-201ENST00000270879 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.05■■■■□ 3.36
FCN3-201ENST00000270879 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.95■■■■□ 3.35
FCN3-201ENST00000270879 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.92■■■■□ 3.34
FCN3-201ENST00000270879 SCRIBQ14160 1630 aa35.92■■■■□ 3.34
FCN3-201ENST00000270879 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
FCN3-201ENST00000270879 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.93■■■■□ 3.18
FCN3-201ENST00000270879 CUX2O14529 1486 aa34.48■■■■□ 3.11
FCN3-201ENST00000270879 NCAPD3P42695 1498 aa34.47■■■■□ 3.11
FCN3-201ENST00000270879 ERCC6Q03468 1493 aa34.46■■■■□ 3.11
FCN3-201ENST00000270879 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.33■■■■□ 3.09
FCN3-201ENST00000270879 SMARCA2P51531 1590 aa34.22■■■■□ 3.07
FCN3-201ENST00000270879 SMARCA4P51532 1647 aa34.19■■■■□ 3.06
FCN3-201ENST00000270879 HMGXB3Q12766 1538 aa34.19■■■■□ 3.06
FCN3-201ENST00000270879 NESP48681 1621 aa34.09■■■■□ 3.05
FCN3-201ENST00000270879 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
FCN3-201ENST00000270879 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
FCN3-201ENST00000270879 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.83■■■■□ 3.01
FCN3-201ENST00000270879 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
FCN3-201ENST00000270879 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.77■■■■□ 3
FCN3-201ENST00000270879 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.68■■■□□ 2.98
FCN3-201ENST00000270879 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.64■■■□□ 2.98
FCN3-201ENST00000270879 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.62■■■□□ 2.97
FCN3-201ENST00000270879 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.43■■■□□ 2.94
FCN3-201ENST00000270879 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.35■■■□□ 2.93
FCN3-201ENST00000270879 TRIM41Q8WV44 630 aa33.31■■■□□ 2.92
FCN3-201ENST00000270879 WIZO95785 1651 aa33.27■■■□□ 2.92
FCN3-201ENST00000270879 WDR62O43379 1518 aa33.26■■■□□ 2.91
FCN3-201ENST00000270879 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.14■■■□□ 2.9
FCN3-201ENST00000270879 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.06■■■□□ 2.88
FCN3-201ENST00000270879 CFTRP13569 1480 aa32.95■■■□□ 2.87
FCN3-201ENST00000270879 OSCARQ8IYS5 282 aa32.88■■■□□ 2.85
FCN3-201ENST00000270879 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
FCN3-201ENST00000270879 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
FCN3-201ENST00000270879 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
FCN3-201ENST00000270879 PRDM2Q13029 1718 aa32.59■■■□□ 2.81
FCN3-201ENST00000270879 IFT140Q96RY7 1462 aa32.48■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.47■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.47■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.47■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.45■■■□□ 2.79
FCN3-201ENST00000270879 TOPBP1Q92547 1522 aa32.38■■■□□ 2.77
FCN3-201ENST00000270879 ARHGEF11O15085 1522 aa32.32■■■□□ 2.76
FCN3-201ENST00000270879 ABCC8Q09428 1581 aa32.28■■■□□ 2.76
FCN3-201ENST00000270879 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
FCN3-201ENST00000270879 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.23■■■□□ 2.75
FCN3-201ENST00000270879 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.15■■■□□ 2.74
FCN3-201ENST00000270879 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.15■■■□□ 2.74
FCN3-201ENST00000270879 CHD1O14646 1710 aa32.12■■■□□ 2.73
FCN3-201ENST00000270879 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
FCN3-201ENST00000270879 FBLN2P98095 1184 aa32.08■■■□□ 2.73
FCN3-201ENST00000270879 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
FCN3-201ENST00000270879 ARAP1Q96P48 1450 aa31.97■■■□□ 2.71
FCN3-201ENST00000270879 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
FCN3-201ENST00000270879 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.93■■■□□ 2.7
FCN3-201ENST00000270879 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
FCN3-201ENST00000270879 SOGA1O94964 1423 aa31.89■■■□□ 2.7
FCN3-201ENST00000270879 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.8■■■□□ 2.68
FCN3-201ENST00000270879 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.78■■■□□ 2.68
FCN3-201ENST00000270879 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
FCN3-201ENST00000270879 WDR97A6NE52 1622 aa31.75■■■□□ 2.67
FCN3-201ENST00000270879 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.71■■■□□ 2.67
FCN3-201ENST00000270879 SYNJ1O43426 1573 aa31.69■■■□□ 2.66
FCN3-201ENST00000270879 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
FCN3-201ENST00000270879 CUX1P39880 1505 aa31.67■■■□□ 2.66
FCN3-201ENST00000270879 GRIN2BQ13224 1484 aa31.65■■■□□ 2.66
FCN3-201ENST00000270879 SYNJ2O15056 1496 aa31.59■■■□□ 2.65
FCN3-201ENST00000270879 PBRM1Q86U86 1689 aa31.5■■■□□ 2.63
FCN3-201ENST00000270879 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.49■■■□□ 2.63
FCN3-201ENST00000270879 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.38■■■□□ 2.61
FCN3-201ENST00000270879 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.36■■■□□ 2.61
FCN3-201ENST00000270879 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
FCN3-201ENST00000270879 GRIN2AQ12879 1464 aa31.24■■■□□ 2.59
FCN3-201ENST00000270879 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.21■■■□□ 2.59
FCN3-201ENST00000270879 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
FCN3-201ENST00000270879 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
FCN3-201ENST00000270879 ADAMTS12P58397 1594 aa31.16■■■□□ 2.58
FCN3-201ENST00000270879 CEP170Q5SW79 1584 aa31.14■■■□□ 2.58
FCN3-201ENST00000270879 NUP160Q12769 1436 aa31.14■■■□□ 2.58
FCN3-201ENST00000270879 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.07■■■□□ 2.57
FCN3-201ENST00000270879 TOP2BQ02880 1626 aa31.05■■■□□ 2.56
FCN3-201ENST00000270879 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.05■■■□□ 2.56
FCN3-201ENST00000270879 SHROOM2Q13796 1616 aa31.03■■■□□ 2.56
FCN3-201ENST00000270879 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.98■■■□□ 2.55
FCN3-201ENST00000270879 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
FCN3-201ENST00000270879 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.86■■■□□ 2.53
FCN3-201ENST00000270879 JPH4Q96JJ6 628 aa30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms