Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERFP50548 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERFP50548 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERFP50548 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERFP50548 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms