RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486389.5

ALKBH6-213, Transcript of alkB homolog 6, human

TSL 3 BASIC

Gene ALKBH6, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ALKBH6-213	ENST00000486389	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		46.13	■■■■■ 4.97
ALKBH6-213	ENST00000486389	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.82	■■■■■ 4.13
ALKBH6-213	ENST00000486389	ABCC9	O60706	1549 aa		39.67	■■■■□ 3.94
ALKBH6-213	ENST00000486389	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.64	■■■■□ 3.78
ALKBH6-213	ENST00000486389	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.41	■■■■□ 3.74
ALKBH6-213	ENST00000486389	NACAD	O15069	1562 aa		38.32	■■■■□ 3.73
ALKBH6-213	ENST00000486389	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.29	■■■■□ 3.72
ALKBH6-213	ENST00000486389	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.19	■■■■□ 3.7
ALKBH6-213	ENST00000486389	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		38.13	■■■■□ 3.69
ALKBH6-213	ENST00000486389	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.42	■■■■□ 3.58
ALKBH6-213	ENST00000486389	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.27	■■■■□ 3.56
ALKBH6-213	ENST00000486389	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.23	■■■■□ 3.55
ALKBH6-213	ENST00000486389	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.13	■■■■□ 3.53
ALKBH6-213	ENST00000486389	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.1	■■■■□ 3.53
ALKBH6-213	ENST00000486389	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.13	■■■■□ 3.38
ALKBH6-213	ENST00000486389	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.11	■■■■□ 3.37
ALKBH6-213	ENST00000486389	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.95	■■■■□ 3.35
ALKBH6-213	ENST00000486389	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.9	■■■■□ 3.34
ALKBH6-213	ENST00000486389	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.7	■■■■□ 3.3
ALKBH6-213	ENST00000486389	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.68	■■■■□ 3.3
ALKBH6-213	ENST00000486389	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.66	■■■■□ 3.3
ALKBH6-213	ENST00000486389	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.55	■■■■□ 3.28
ALKBH6-213	ENST00000486389	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.46	■■■■□ 3.27
ALKBH6-213	ENST00000486389	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.42	■■■■□ 3.26
ALKBH6-213	ENST00000486389	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.4	■■■■□ 3.26
ALKBH6-213	ENST00000486389	WIZ	O95785	1651 aa		35.36	■■■■□ 3.25
ALKBH6-213	ENST00000486389	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.35	■■■■□ 3.25
ALKBH6-213	ENST00000486389	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.33	■■■■□ 3.25
ALKBH6-213	ENST00000486389	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.21	■■■■□ 3.23
ALKBH6-213	ENST00000486389	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.15	■■■■□ 3.22
ALKBH6-213	ENST00000486389	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.92	■■■■□ 3.18
ALKBH6-213	ENST00000486389	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.56	■■■■□ 3.12
ALKBH6-213	ENST00000486389	NES	P48681	1621 aa		34.41	■■■■□ 3.1
ALKBH6-213	ENST00000486389	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.38	■■■■□ 3.09
ALKBH6-213	ENST00000486389	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.35	■■■■□ 3.09
ALKBH6-213	ENST00000486389	CFTR	P13569	1480 aa		34.2	■■■■□ 3.07
ALKBH6-213	ENST00000486389	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.18	■■■■□ 3.06
ALKBH6-213	ENST00000486389	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.15	■■■■□ 3.06
ALKBH6-213	ENST00000486389	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.02	■■■■□ 3.04
ALKBH6-213	ENST00000486389	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.97	■■■■□ 3.03
ALKBH6-213	ENST00000486389	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.95	■■■■□ 3.03
ALKBH6-213	ENST00000486389	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ALKBH6-213	ENST00000486389	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
ALKBH6-213	ENST00000486389	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.76	■■■■□ 3
ALKBH6-213	ENST00000486389	CUX2	O14529	1486 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ALKBH6-213	ENST00000486389	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ALKBH6-213	ENST00000486389	WDR62	O43379	1518 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ALKBH6-213	ENST00000486389	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ALKBH6-213	ENST00000486389	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ALKBH6-213	ENST00000486389	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.45	■■■□□ 2.94
ALKBH6-213	ENST00000486389	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ALKBH6-213	ENST00000486389	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ALKBH6-213	ENST00000486389	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ALKBH6-213	ENST00000486389	CUX1	P39880	1505 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ALKBH6-213	ENST00000486389	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ALKBH6-213	ENST00000486389	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ALKBH6-213	ENST00000486389	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.28	■■■□□ 2.92
ALKBH6-213	ENST00000486389	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
ALKBH6-213	ENST00000486389	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ALKBH6-213	ENST00000486389	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ALKBH6-213	ENST00000486389	SOGA1	O94964	1423 aa		33.06	■■■□□ 2.88
ALKBH6-213	ENST00000486389	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
ALKBH6-213	ENST00000486389	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ALKBH6-213	ENST00000486389	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
ALKBH6-213	ENST00000486389	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
ALKBH6-213	ENST00000486389	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.85	■■■□□ 2.85
ALKBH6-213	ENST00000486389	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.84	■■■□□ 2.85	4e-8	■■■■■ 31.9
ALKBH6-213	ENST00000486389	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ALKBH6-213	ENST00000486389	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ALKBH6-213	ENST00000486389	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.85
ALKBH6-213	ENST00000486389	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
ALKBH6-213	ENST00000486389	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ALKBH6-213	ENST00000486389	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.67	■■■□□ 2.82
ALKBH6-213	ENST00000486389	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.63	■■■□□ 2.81
ALKBH6-213	ENST00000486389	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ALKBH6-213	ENST00000486389	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ALKBH6-213	ENST00000486389	EEA1	Q15075	1411 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ALKBH6-213	ENST00000486389	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ALKBH6-213	ENST00000486389	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.8
ALKBH6-213	ENST00000486389	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.49	■■■□□ 2.79
ALKBH6-213	ENST00000486389	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.45	■■■□□ 2.79
ALKBH6-213	ENST00000486389	IGF1R	P08069	1367 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ALKBH6-213	ENST00000486389	FBLN2	P98095	1184 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ALKBH6-213	ENST00000486389	CHD1	O14646	1710 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ALKBH6-213	ENST00000486389	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.39	■■■□□ 2.78
ALKBH6-213	ENST00000486389	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ALKBH6-213	ENST00000486389	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ALKBH6-213	ENST00000486389	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ALKBH6-213	ENST00000486389	KIF21B	O75037	1637 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ALKBH6-213	ENST00000486389	CUL7	Q14999	1698 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ALKBH6-213	ENST00000486389	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ALKBH6-213	ENST00000486389	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ALKBH6-213	ENST00000486389	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ALKBH6-213	ENST00000486389	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ALKBH6-213	ENST00000486389	NUP160	Q12769	1436 aa		32.05	■■■□□ 2.72

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