Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SLC8B1-211ENST00000550672 2925 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.396e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.46e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 212.53□□□□□ -0.46e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.416e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SUPT6H-210ENST00000584285 446 ntTSL 312.4□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MEIS2-221ENST00000561163 1643 ntTSL 212.4□□□□□ -0.426e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.466e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 412.11□□□□□ -0.476e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.486e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.56e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.576e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLTM-203ENST00000432750 2383 ntTSL 511.31□□□□□ -0.66e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-218ENST00000528931 2868 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.66e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 511.14□□□□□ -0.636e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLTM-212ENST00000557924 3021 ntTSL 211.06□□□□□ -0.646e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCMT1-204ENST00000564011 1168 ntTSL 510.91□□□□□ -0.666e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 FAM60A-206ENST00000539409 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.696e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.726e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.766e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCMT1-205ENST00000570981 612 ntTSL 210.07□□□□□ -0.86e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.816e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-231ENST00000537344 3774 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLTM-202ENST00000380516 4147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.896e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-221ENST00000530691 6307 ntTSL 1 (best)9.44□□□□□ -0.96e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SUPT6H-202ENST00000347486 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.936e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-217ENST00000527546 3358 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.956e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZNF248-208ENST00000611278 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.046e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLTM-208ENST00000492526 3022 ntTSL 28.4□□□□□ -1.066e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.076e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-204ENST00000451772 536 ntTSL 38.31□□□□□ -1.086e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.26e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PDHX-208ENST00000533550 584 ntTSL 47.48□□□□□ -1.216e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.36□□□□□ -1.236e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.286e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TTC17-206ENST00000525135 1048 ntTSL 26.85□□□□□ -1.316e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 46.57□□□□□ -1.366e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TTC17-213ENST00000533554 396 ntTSL 36.24□□□□□ -1.416e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TUSC3-212ENST00000511783 1203 ntTSL 56.18□□□□□ -1.426e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.466e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZNF248-205ENST00000395874 436 ntTSL 35.9□□□□□ -1.466e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 CNOT4-209ENST00000473470 707 ntTSL 25.79□□□□□ -1.486e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.56e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TTC17-203ENST00000418561 575 ntTSL 35.46□□□□□ -1.546e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SLTM-211ENST00000557791 334 ntTSL 35.37□□□□□ -1.556e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 FAM60A-209ENST00000544921 845 ntTSL 45.34□□□□□ -1.556e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TTC17-207ENST00000525543 3142 ntTSL 25.32□□□□□ -1.566e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.576e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 FAM60A-202ENST00000448582 3111 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.576e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 TUSC3-207ENST00000508446 457 ntTSL 35.24□□□□□ -1.576e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 54.97□□□□□ -1.616e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-201ENST00000419359 517 ntTSL 24.77□□□□□ -1.656e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.67□□□□□ -1.666e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LCMT1-213ENST00000577157 522 ntTSL 32.76□□□□□ -1.976e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.932e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 DDB1-224ENST00000545894 2282 ntTSL 210.84□□□□□ -0.674e-14■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-11■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.543e-11■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.563e-11■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.797e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 AK2-205ENST00000469238 423 ntTSL 27.01□□□□□ -1.295e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 AK2-203ENST00000466029 223 ntTSL 35.46□□□□□ -1.545e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.77■□□□□ 0.763e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 318.79■□□□□ 0.63e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 314.95□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.21e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.11e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.081e-10■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-236ENST00000521981 552 ntTSL 59.54□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-230ENST00000521250 592 ntTSL 49.12□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-238ENST00000521986 2393 ntTSL 28.1□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-227ENST00000521029 584 ntTSL 47.82□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-246ENST00000523539 3236 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-7■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 217.82■□□□□ 0.448e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.388e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.078e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-209ENST00000515838 943 ntTSL 215.1■□□□□ 0.018e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.248e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.248e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.288e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.378e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.458e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 311.41□□□□□ -0.588e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.288e-12■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.353e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 LRBA-203ENST00000503716 3712 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.483e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 20.5
TARDBPQ13148 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 20.5
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