Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX8Q9Y5X2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX8Q9Y5X2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX8Q9Y5X2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX8Q9Y5X2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX8Q9Y5X2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms