Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP24Q9UPU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP24Q9UPU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP24Q9UPU5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP24Q9UPU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms