Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM33Q9UPN9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM33Q9UPN9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM33Q9UPN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM33Q9UPN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM33Q9UPN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms