Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC17A6Q9P2U8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC17A6Q9P2U8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms