Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLCO1C1Q9NYB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLCO1C1Q9NYB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms