Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BHLHE41Q9C0J9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BHLHE41Q9C0J9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHLHE41Q9C0J9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BHLHE41Q9C0J9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms