Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TSSK3Q96PN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSSK3Q96PN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSSK3Q96PN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSSK3Q96PN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSSK3Q96PN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms