Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR4Q96PI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR4Q96PI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPRR4Q96PI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms