Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSNARE1Q96NA8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSNARE1Q96NA8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms