Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71F1Q96KD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71F1Q96KD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71F1Q96KD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms