Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEURL3Q96EH8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEURL3Q96EH8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEURL3Q96EH8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEURL3Q96EH8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms