Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC107Q8WV48 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC107Q8WV48 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC107Q8WV48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms