Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSNK2A3Q8NEV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2A3Q8NEV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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