Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMCO5AQ8N6Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMCO5AQ8N6Q1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO5AQ8N6Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO5AQ8N6Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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