Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EID3Q8N140 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EID3Q8N140 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EID3Q8N140 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EID3Q8N140 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms