Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMB4Q86W47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMB4Q86W47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMB4Q86W47 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB4Q86W47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms