Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KCNMB4Q86W47 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNMB4Q86W47 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNMB4Q86W47 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNMB4Q86W47 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNMB4Q86W47 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KCNMB4Q86W47 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KCNMB4Q86W47 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KCNMB4Q86W47 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNMB4Q86W47 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
KCNMB4Q86W47 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KCNMB4Q86W47 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KCNMB4Q86W47 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KCNMB4Q86W47 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KCNMB4Q86W47 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KCNMB4Q86W47 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KCNMB4Q86W47 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KCNMB4Q86W47 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KCNMB4Q86W47 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KCNMB4Q86W47 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KCNMB4Q86W47 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KCNMB4Q86W47 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KCNMB4Q86W47 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KCNMB4Q86W47 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KCNMB4Q86W47 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KCNMB4Q86W47 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
KCNMB4Q86W47 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCNMB4Q86W47 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCNMB4Q86W47 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNMB4Q86W47 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCNMB4Q86W47 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KCNMB4Q86W47 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCNMB4Q86W47 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KCNMB4Q86W47 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCNMB4Q86W47 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KCNMB4Q86W47 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KCNMB4Q86W47 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KCNMB4Q86W47 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
KCNMB4Q86W47 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNMB4Q86W47 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCNMB4Q86W47 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCNMB4Q86W47 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
KCNMB4Q86W47 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNMB4Q86W47 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KCNMB4Q86W47 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
KCNMB4Q86W47 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
KCNMB4Q86W47 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KCNMB4Q86W47 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KCNMB4Q86W47 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
KCNMB4Q86W47 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KCNMB4Q86W47 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
KCNMB4Q86W47 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
KCNMB4Q86W47 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KCNMB4Q86W47 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KCNMB4Q86W47 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KCNMB4Q86W47 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KCNMB4Q86W47 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KCNMB4Q86W47 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KCNMB4Q86W47 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB4Q86W47 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KCNMB4Q86W47 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNMB4Q86W47 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNMB4Q86W47 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNMB4Q86W47 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KCNMB4Q86W47 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNMB4Q86W47 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNMB4Q86W47 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNMB4Q86W47 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNMB4Q86W47 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNMB4Q86W47 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNMB4Q86W47 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNMB4Q86W47 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNMB4Q86W47 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNMB4Q86W47 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNMB4Q86W47 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNMB4Q86W47 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNMB4Q86W47 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNMB4Q86W47 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNMB4Q86W47 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNMB4Q86W47 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNMB4Q86W47 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNMB4Q86W47 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNMB4Q86W47 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNMB4Q86W47 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNMB4Q86W47 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNMB4Q86W47 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNMB4Q86W47 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNMB4Q86W47 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNMB4Q86W47 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNMB4Q86W47 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNMB4Q86W47 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNMB4Q86W47 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNMB4Q86W47 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNMB4Q86W47 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNMB4Q86W47 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNMB4Q86W47 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNMB4Q86W47 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNMB4Q86W47 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KCNMB4Q86W47 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNMB4Q86W47 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms