Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
R3HCC1LQ7Z5L2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
R3HCC1LQ7Z5L2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3HCC1LQ7Z5L2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3HCC1LQ7Z5L2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms