Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHMP1BQ7LBR1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMP1BQ7LBR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP1BQ7LBR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms