Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPECC1Q5M775 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPECC1Q5M775 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPECC1Q5M775 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPECC1Q5M775 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms