Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SPECC1Q5M775 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SPECC1Q5M775 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SPECC1Q5M775 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SPECC1Q5M775 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPECC1Q5M775 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SPECC1Q5M775 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPECC1Q5M775 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPECC1Q5M775 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SPECC1Q5M775 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SPECC1Q5M775 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SPECC1Q5M775 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SPECC1Q5M775 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SPECC1Q5M775 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SPECC1Q5M775 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPECC1Q5M775 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPECC1Q5M775 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPECC1Q5M775 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SPECC1Q5M775 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SPECC1Q5M775 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPECC1Q5M775 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPECC1Q5M775 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPECC1Q5M775 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SPECC1Q5M775 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SPECC1Q5M775 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SPECC1Q5M775 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SPECC1Q5M775 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SPECC1Q5M775 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SPECC1Q5M775 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SPECC1Q5M775 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SPECC1Q5M775 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SPECC1Q5M775 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SPECC1Q5M775 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SPECC1Q5M775 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SPECC1Q5M775 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SPECC1Q5M775 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SPECC1Q5M775 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SPECC1Q5M775 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SPECC1Q5M775 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SPECC1Q5M775 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SPECC1Q5M775 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SPECC1Q5M775 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SPECC1Q5M775 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SPECC1Q5M775 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SPECC1Q5M775 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SPECC1Q5M775 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SPECC1Q5M775 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPECC1Q5M775 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPECC1Q5M775 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPECC1Q5M775 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPECC1Q5M775 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPECC1Q5M775 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPECC1Q5M775 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPECC1Q5M775 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPECC1Q5M775 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPECC1Q5M775 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPECC1Q5M775 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPECC1Q5M775 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPECC1Q5M775 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPECC1Q5M775 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPECC1Q5M775 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPECC1Q5M775 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPECC1Q5M775 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPECC1Q5M775 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPECC1Q5M775 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPECC1Q5M775 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SPECC1Q5M775 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SPECC1Q5M775 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SPECC1Q5M775 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPECC1Q5M775 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPECC1Q5M775 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPECC1Q5M775 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SPECC1Q5M775 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPECC1Q5M775 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPECC1Q5M775 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SPECC1Q5M775 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SPECC1Q5M775 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SPECC1Q5M775 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPECC1Q5M775 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPECC1Q5M775 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPECC1Q5M775 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SPECC1Q5M775 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SPECC1Q5M775 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPECC1Q5M775 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPECC1Q5M775 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPECC1Q5M775 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SPECC1Q5M775 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPECC1Q5M775 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SPECC1Q5M775 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SPECC1Q5M775 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPECC1Q5M775 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPECC1Q5M775 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPECC1Q5M775 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SPECC1Q5M775 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SPECC1Q5M775 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms