Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CMPK2Q5EBM0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CMPK2Q5EBM0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CMPK2Q5EBM0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMPK2Q5EBM0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMPK2Q5EBM0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms