Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGGHGQ32M88 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGGHGQ32M88 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGGHGQ32M88 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGGHGQ32M88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms