Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB39AQ14964 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB39AQ14964 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB39AQ14964 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB39AQ14964 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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