Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RAB39AQ14964 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAB39AQ14964 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAB39AQ14964 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAB39AQ14964 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAB39AQ14964 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RAB39AQ14964 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB39AQ14964 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAB39AQ14964 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB39AQ14964 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB39AQ14964 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB39AQ14964 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB39AQ14964 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB39AQ14964 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB39AQ14964 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB39AQ14964 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB39AQ14964 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB39AQ14964 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB39AQ14964 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB39AQ14964 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB39AQ14964 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB39AQ14964 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAB39AQ14964 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB39AQ14964 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB39AQ14964 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAB39AQ14964 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAB39AQ14964 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB39AQ14964 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB39AQ14964 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB39AQ14964 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB39AQ14964 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RAB39AQ14964 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RAB39AQ14964 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAB39AQ14964 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB39AQ14964 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB39AQ14964 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB39AQ14964 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB39AQ14964 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB39AQ14964 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB39AQ14964 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB39AQ14964 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAB39AQ14964 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB39AQ14964 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB39AQ14964 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB39AQ14964 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB39AQ14964 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB39AQ14964 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB39AQ14964 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB39AQ14964 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB39AQ14964 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB39AQ14964 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB39AQ14964 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB39AQ14964 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB39AQ14964 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB39AQ14964 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB39AQ14964 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB39AQ14964 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB39AQ14964 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB39AQ14964 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB39AQ14964 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB39AQ14964 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB39AQ14964 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB39AQ14964 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB39AQ14964 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB39AQ14964 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAB39AQ14964 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB39AQ14964 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB39AQ14964 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB39AQ14964 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB39AQ14964 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB39AQ14964 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB39AQ14964 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB39AQ14964 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB39AQ14964 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB39AQ14964 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB39AQ14964 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB39AQ14964 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB39AQ14964 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB39AQ14964 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB39AQ14964 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB39AQ14964 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB39AQ14964 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB39AQ14964 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB39AQ14964 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB39AQ14964 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB39AQ14964 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB39AQ14964 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
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