Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHAF1BQ13112 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAF1BQ13112 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHAF1BQ13112 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHAF1BQ13112 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1BQ13112 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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