Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHAF1BQ13112 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAF1BQ13112 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHAF1BQ13112 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHAF1BQ13112 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHAF1BQ13112 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHAF1BQ13112 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CHAF1BQ13112 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CHAF1BQ13112 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAF1BQ13112 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHAF1BQ13112 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHAF1BQ13112 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAF1BQ13112 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHAF1BQ13112 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHAF1BQ13112 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHAF1BQ13112 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHAF1BQ13112 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHAF1BQ13112 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CHAF1BQ13112 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHAF1BQ13112 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHAF1BQ13112 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHAF1BQ13112 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAF1BQ13112 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1BQ13112 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAF1BQ13112 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAF1BQ13112 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAF1BQ13112 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAF1BQ13112 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHAF1BQ13112 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHAF1BQ13112 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1BQ13112 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1BQ13112 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAF1BQ13112 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHAF1BQ13112 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHAF1BQ13112 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHAF1BQ13112 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHAF1BQ13112 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHAF1BQ13112 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHAF1BQ13112 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1BQ13112 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHAF1BQ13112 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHAF1BQ13112 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHAF1BQ13112 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHAF1BQ13112 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHAF1BQ13112 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHAF1BQ13112 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHAF1BQ13112 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1BQ13112 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHAF1BQ13112 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHAF1BQ13112 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAF1BQ13112 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHAF1BQ13112 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1BQ13112 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHAF1BQ13112 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1BQ13112 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHAF1BQ13112 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1BQ13112 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1BQ13112 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1BQ13112 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1BQ13112 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1BQ13112 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHAF1BQ13112 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1BQ13112 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHAF1BQ13112 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHAF1BQ13112 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHAF1BQ13112 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHAF1BQ13112 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHAF1BQ13112 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHAF1BQ13112 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHAF1BQ13112 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHAF1BQ13112 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHAF1BQ13112 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHAF1BQ13112 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1BQ13112 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1BQ13112 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
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