Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECH1Q13011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECH1Q13011 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECH1Q13011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECH1Q13011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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