Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCDQ05655 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCDQ05655 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKCDQ05655 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKCDQ05655 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms