Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFI35P80217 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFI35P80217 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFI35P80217 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFI35P80217 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFI35P80217 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFI35P80217 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFI35P80217 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IFI35P80217 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFI35P80217 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFI35P80217 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFI35P80217 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFI35P80217 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFI35P80217 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFI35P80217 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFI35P80217 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IFI35P80217 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFI35P80217 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFI35P80217 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFI35P80217 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFI35P80217 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFI35P80217 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IFI35P80217 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFI35P80217 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFI35P80217 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFI35P80217 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IFI35P80217 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFI35P80217 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFI35P80217 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFI35P80217 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFI35P80217 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFI35P80217 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFI35P80217 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IFI35P80217 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IFI35P80217 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFI35P80217 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IFI35P80217 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFI35P80217 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFI35P80217 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
IFI35P80217 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFI35P80217 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFI35P80217 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFI35P80217 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFI35P80217 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFI35P80217 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFI35P80217 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFI35P80217 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFI35P80217 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFI35P80217 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFI35P80217 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFI35P80217 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFI35P80217 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IFI35P80217 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFI35P80217 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFI35P80217 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFI35P80217 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFI35P80217 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IFI35P80217 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IFI35P80217 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFI35P80217 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms