Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A2P55011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A2P55011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A2P55011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A2P55011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A2P55011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms