Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DNA2P51530 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DNA2P51530 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNA2P51530 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNA2P51530 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DNA2P51530 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DNA2P51530 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNA2P51530 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNA2P51530 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DNA2P51530 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNA2P51530 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DNA2P51530 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNA2P51530 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNA2P51530 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNA2P51530 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNA2P51530 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNA2P51530 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNA2P51530 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNA2P51530 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNA2P51530 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNA2P51530 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNA2P51530 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNA2P51530 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNA2P51530 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNA2P51530 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNA2P51530 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNA2P51530 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNA2P51530 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNA2P51530 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNA2P51530 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNA2P51530 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNA2P51530 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNA2P51530 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNA2P51530 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DNA2P51530 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DNA2P51530 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DNA2P51530 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNA2P51530 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNA2P51530 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNA2P51530 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNA2P51530 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNA2P51530 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNA2P51530 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNA2P51530 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNA2P51530 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNA2P51530 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNA2P51530 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNA2P51530 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNA2P51530 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNA2P51530 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNA2P51530 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNA2P51530 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNA2P51530 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNA2P51530 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNA2P51530 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNA2P51530 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNA2P51530 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms